实行校、院两级管理和基地主任负责制，下设无机化学实验室、分析化学实验室、物理化学实验室、有机化学实验室、仪器分析实验室、应用化学专业实验室和余区化学实验室，按照“人员统一管理、仪器设备统一使用、实验用品统一购买、教学任务统一安排”的“四个统一”方式进行日常管理和运行。
自2000年以来，“国家工科化学基地”得到了各级部门的大力支持，累计投入近1200万元（不含化学楼建设），尤其是近4年共获得“中央级普通高等学校办学基本条件建设”和学校“本科教学实验室条件建设”项目经费支持585.0万元，补充、更新、淘汰了90%以上的常规仪器；购置了高效液相色谱仪、气相色谱仪、傅立叶红外光谱仪、电化学工作站、比表面和孔隙度吸附仪等大型仪器设备，实验条件得到进一步改善，基础实验全部达到1人1套，且满足了不同层次教学、开放实验、大学生创新训练计划等的需要，为切实提高人才培养质量奠定了坚实基础。
实验室全部装配现代化标准试验台，环境卫生、整洁，确保师生身体健康，且具有防火、防盗、防毒、防爆、防破坏等基本设施；实验教学和实验管理实行计算机管理，高压容器、易燃、易爆、有毒等物品按国家有关规定存放，并有专人管理，药品库配有监控报警装置。
